牡丹按生态习性不同，可分为四大品种群——中原牡丹品种群、江南牡丹品种群、西北牡丹品种群和西南牡丹品种群。1995年江苏省苏州市科委“盆栽牡丹研究”课题组研究后认为：荷泽牡丹(中原牡丹)好于洛阳牡丹(中原牡丹)，宁国牡丹(江南牡丹)好于荷泽牡丹。山东农业大学牡丹研究专家喻衡教授所著《牡丹》一书中也认为：“江南地方品种(安徽宁国牡丹)盆栽效果好。”江南牡丹品种群枝繁叶茂，根系短浅，对长江以南的高温多湿自然条件具有良好的适应能力，耐高温、高湿。因此南方应选择江南品种群，而南方较适宜盆栽的品种有西施、粉莲、昌红、呼红、雀好、四旋、羽红等。其次要选择生长健壮、无病虫害、枝条分布匀称、花芽充实饱满、3～4年生的幼龄植株。品种的选择、植株的优劣，对上盆后植株长势的强弱、开花率的高低、花朵丰满与大小等都有直接的关系。
2盆器选择
      牡丹盆栽与其他盆栽花卉一样，所选用的容器一般为透气、排水性能好的盆器。《花经》中云：“牡丹用盆，以泥烧之黄色或黑色瓦盆最佳，缘此泥盆最易排水也。”可见古人对盆栽牡丹用盆很为讲究。但其缺点是工艺粗糙、式样单调且不美观。为了达到既美观又排水透气好的目的，一般选择紫砂盆或采用套盆方式，用素烧泥盆栽植牡丹置放人陶瓷盆或塑料盆中。牡丹为深根花卉，宜采用高盆栽培。盆高一般为42 cm、口径为38 cm、底径为30cm，可视牡丹植株大小来定花盆的大小，不能只局限所介绍的规格。总之，牡丹植株上盆后，根系能有一个适宜生长的空间、花与盆的比例适当为选盆的标准。
3盆土配制
      牡丹为肉质根，须根较为发达。由于盆栽牡丹受盆器的局限，因此，所配制的盆土要比露地栽培用土严格得多。盆栽牡丹一定要用排水良好、含腐殖质较高的中性土壤或微酸性土壤，一般以pH值6．5～7为宜。其盆土配方为：园土2份、粗河沙(或煤矿渣、珍珠岩)2份、油饼粉或家禽粪1份，腐叶土5份。其中油饼粉或家禽粪须经过充分发酵腐熟，再与其他基质拌和均匀。为了减低植株的发病率，对所配制的盆土须经消毒后堆积60 天方可使用。一般多采用日光消毒或化学药剂消毒方法。①日光消毒法是在夏秋高温季节，将配制好的盆土，薄薄平摊在水泥地面上，并经常翻动暴晒10d左右。②化学药剂消毒法，是用65％的代森锌粉剂每盆按15 g掺人盆土中，此方法杀菌效果好，操作简便，缺点是残留药剂会对植株生长造成影响。
4上盆栽种
      牡丹上盆最适宜的时间是在9月中旬～10月下旬。牡丹植株上盆前须经1～2 d风干根系部分水份，使其根系变软(但不可暴晒)。因牡丹根系较脆，随起随栽易折断，对植株造成伤害。牡丹植株上盆时应适当修剪根系，伤口处用硫磺粉涂抹或用65％的代森锌0．167％～O．2％浓度的溶液稍浸泡一下进行消毒，以防烂根。盆底排水孔要先垫瓦片，再垫木炭屑，然后垫一层2 cm厚的粗河沙或珍珠岩，以达到排水透气目的，最后再垫一层营养土。移植时将植株根系理顺，用小花铲边填土边摇晃花盆压实，待土填至花盆容积的2／3时，轻轻提抖一下
植株，再填土捣实。所填盆土应低于花盆上口3 cm，便于今后日常管理。上盆定植后浇透水，新上盆牡丹4个月内切不可施肥。
5合理施肥
     牡丹喜肥。盆栽后，如长时间得不到养分的补充，会因饥饿而长势减弱，并易发生病害，所以要根据需要适时追肥。新上盆的牡丹，盆土配制时加入的基肥，能够满足植株前6个月的生长发育的需求，不需要追肥。而7～8月天气酷热，牡丹进入半休眠状态，只要保持盆土湿润，也不需追肥。盆栽牡丹每年追肥应不少4次。新上盆的牡丹第1次施肥应在翌年开花前的3月上旬，花前施肥有利于花大而色艳；第2次在花谢之后施肥，有利于枝条的
健壮生长；第3次施肥一般在立秋之后，有利于花芽生长饱满，增加来年花量；第4次施肥一般在11月份，以便来年生长旺盛。12月至翌年2月牡丹进入休眠期，此时不宜施肥。盆栽牡丹所施肥料以有机肥为主，化学肥料虽简便易操作，但其缺点是肥效短，易导致盆土板结，造成透气性差。常用的肥料主要有家畜、家禽的粪便和菜籽饼，但必须经充分腐熟以后方可使用。亦可选用生物有机肥料。施肥的要求是宁淡勿浓，也就是追施液肥时，一是浓度要低，二是施肥不要过勤，否则会适得其反。
6适量浇水
     牡丹为肉质根，若盆土长期湿度过大，会造成根烂叶黄，易发病害而导致植株死亡。因此，如何把握适量浇水是盆栽牡丹管理的关键。一般盆土湿润度保持在20％左右为宜，做到不干不浇、浇则浇透，这是盆栽牡丹浇水的原则。浇水时间要根据不同的季节而定，要求水温与土温相差不大。如夏季忌在10：。0～16。00间浇水。夏季高温适当增加浇水量。牡丹在11月至翌年的2月为休眠期，只要盆土湿润，一般不需浇水。多雨季节，最好将花盆移到避雨处养护，以防积水烂根。
7病虫害防治
      盆栽牡丹最易发生灰霉病、炭疽病和叶斑病等。对牡丹的病害防治，应以预防为主。①加强盆栽牡丹日常管理，促使生长健壮，增加抗病能力，同时保持盆花通风、见光和透气。②栽植前，用70％的甲基托布津可湿性粉剂0．167％浓度的溶液或65％的代森锌可湿性粉剂．浓度的溶液浸泡根部10 min。展叶后至花前用50％多菌灵可湿性粉剂0．167％～0．2％浓度的溶液喷洒2～3次。高温季节，每10～15 d可60％的代森锌可湿性粉剂0．167％浓度的溶液或70％的托布津可湿性粉剂0．125％～O．167％浓度的溶液喷洒防病。③及时剪去病枝叶，集中焚毁，避免传染。这一点很重要，因为牡丹一旦染病很难治愈，必需连根拔除销毁。另处，从我们近两年栽培试验来看，在10月下旬至]1月中旬落叶后，每隔10天进行1次枝干和地面的化学药剂处理比叶前防治效果更好，来年长出的新叶更加鲜艳亮丽。牡丹一般虫害较少，主要是为害根部的蛴螬、蝼蛄和为害枝干的天牛，当出现幼虫时，及时用40％氧化乐果乳油0．1％浓度的溶液或50％辛硫磷乳油0．1％浓度的溶液喷洒枝干与盆土表面，可收到良好效果。
8整形修剪
      为了使牡丹枝条分布均衡合理，需进行整形修剪。修剪工作包括定主干、除芽、疏蕾与剪残枝枯叶。牡丹修剪的时间一般每年进行两次，第1次修剪在3月上旬，主要是定干、除芽与疏蕾，此时侧芽与萌蘖芽生长到8 cm左右，花蕾直径长到1．4 cm左右，叶片渐展环抱新枝一周，应及时进行修剪。①定干，就是选留几个分布匀称的萌蘖芽为“主干”，组成“丛冠”，每盆保持3～5个分布均匀的健壮枝条。②除芽，就是用手直接掰掉不需保留的侧芽，每个枝条留1～2个外侧花芽即可。③疏蕾，为保持优雅的花姿，必须疏掉过多的花蕾，使其养分集中供应主蕾开化。第2次修剪在牡丹花谢后，剪除残花、枯叶与枯枝，主要是为了减少营养的消耗，保持株型的整洁美观。
9光照管理
      牡丹喜阳但又怕阳光曝晒。根据这一习性，为了使牡丹株形生长均匀完美，既要保证牡丹阳光充足、四面通风，又要避免夏季的高温曝晒。①进人夏季高温时，需利用遮阳网遮挡直射强光，但要保证有50％散射光照射牡丹，所搭遮阳网要达到一定的高度，确保其通风良好；傍晚最好能撤除遮阴网，让其通风透气。②为确保盆栽牡丹生长均称，植株四周均衡接受光照，在早春生长盛期，可每隔10～15 天转盆1次，促使株形生长均匀美观。